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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T人体体細胞都可以辨识肉瘤人体体細胞从表面的首要企业混溶性符合体(MHC)呈递的抗原而促发天然免疫系统细胞膜反响。MHC I类(MHC-I)碳原子结构与CD8+ T人体体細胞相护用途,其呈递的肽首要来都依靠于于内源性胞质淀粉酶的淀粉酶酶体分解,而MHC II类(MHC-II)碳原子结构首要描述于专业技术抗原提呈人体体細胞,与CD4+ T人体体細胞相护用途,其呈递的肽来源于按照内体经过分解的胞外和胞内淀粉酶(图1)。于是,辨识由MHC碳原子结构呈递的肉瘤抗原关于设置依靠T人体体細胞辨识和毒杀肉瘤人体体細胞的效果和平安的肠癌天然免疫系统细胞膜辽法是至关最重要的。为质谱(MS)的天然免疫系统细胞膜肽组学(Immunopeptidomics)都可以从三种人体体細胞系、肉瘤企业和安全企业中高通芯片量、一直监定MHC搭配肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原含有MHC以及其构建肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到天然免疫肽队列及其翻泽后装饰问题,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头至尾测序的技术,不依赖现有数据库,更为重要通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰厚的大数据进行分析文章为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递肺部肿瘤抗原的路经

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

NO.1 实验所过程

NO.2 设备显著特点

NO.3 阐述相关内容(区域)

NO.4 送样提倡

例子探讨

01 缘由调查

散文题目的:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

提出杂志期刊:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)都是种核输入输出蛋清,在癌症复发中不时过表达爱,做以为癌肿引发的驱动程序的因素。目前为止,靶点XPO1的小氧分子正被用来作为药学治癌药剂。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫检测肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 一种生活原于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肉瘤-免疫抗体治療

的文章题目大全:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

发过刊物:Nature Communications IF:16.6 2023

恶性淋巴肿瘤胸膜间皮瘤(MPM)一种效果不健康的侵蚀性性淋巴肿瘤。伴随替换成的调理实施方案短缺药用价值,由于十分困难必须要新的调理措施。由此可见其T生殖细胞侵润,小说家如果MPM一个好的调理性肝癌防疫针的指标。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用体系结构质谱的免疫系统肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 梭形细胞肿瘤胸膜间皮瘤免役肽组学论文检测

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 日常细菌mRNA预防针设计规划

软文题目的:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

收录杂志社:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过应用场景质谱的天然免疫肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌交叉感染的Hela神经内部和HCT-116神经内部中监定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱个人心得体会

抗体肽组学是核脂肪酸组学的一些最快提升的支系,它精益求精于研究分析抗体操作系统中由通常阻止混溶性挽回体(MHC)或人类白神经元计数膜抗原(HLA)原子核呈递的抗体肽。以上抗体肽是神经元膜外壁呈递的肽段,也能被T神经元膜判别,才能引起抗体反馈。为质谱的抗体肽组学都称得上签别MHC核血清呈递肽的金基准方式 ,也能立即签别有差异生理特点和病检形态下有差异阻止和神经元膜形式中的抗体肽组,比如说直营瘤或病毒是什么感梁的神经元膜。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的血清组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫抗体肽组检查测量功能,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,就能准确无误且会直接保证免疫力抗体肽回文序列,显示更好非类型免疫力抗体肽,层层落实筛分出牢靠新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

符合论文资料

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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