
近日,扬州医学院专业弟一附属医院门诊医院门诊王学浩科学院院士开发团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向疗法精力基础代谢检测分析服务。
用英语主题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文版文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
企业客户单位名称:南京医科大学
探究的原材料:细胞
拜谱作为的服务:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向疗法能量场消化吸收组
技术应用路线规划:
学习结局
01、YBX1被亲子鉴定为HCC中糖酵解的重点DNA
本研究概述抓取HCC恶性肿癌模本(n=7)的单生殖癌内部RNA测序数据表格显示集判定概述,显示糖酵解亲水性主要集中点在恶性肿癌生殖癌内部中,hdWGCNA概述分辨出9个什么是基因功能(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的极限生活工作概述判定YBX1为独立自主极限生活工作的风险因素分析(图1H)。进一次融合IHC、WB实验室和恶性肿癌组建与紧邻非恶性肿癌组建的房间转录组学数据表格显示集可确认YBX1是肝生殖癌内部癌开展的内在靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被来确定为调低HCC组织细胞糖酵解的重点的因素
02、YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗体力新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1通过并推动YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1融合并催进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化开展其磷碱化,进而推进其核转位
进每两步测试YBX1的O-GlcNAc糖基化可不可以直接影响其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC癌細胞中或用OGT减缓剂OSMI-1治理 ,YBX1淀粉酶级别相关性大幅度降低,YBX1磷酸性反应相关性才能减少(图4A-C)。IP实验英文彰显,在类似的Flag-YBX1底物级别下,YBX1-WT的磷酸性反应级别相关性高过YBX1-T57A,是由于磷酸性反应的加大不只是仅是由于会高的YBX1淀粉酶呈现方法(图4D)。分离法了核和质成分出现 TMG治理 的HCC癌細胞中YBX1核呈现方法的变高(图4E-F),进每两步出现 YBX1磷酸性反应的重要性调准指数是AKT(图4G-I)。这么多出现 突出O-GlcNAc糖基化在使得其磷酸性反应来提高YBX1淀粉酶保持稳界定并使得核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 体现有弊于其进一大步突发磷酸性反应体现并也能推动其核转位
05、YBX1推动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1催进PKM2转录
06、YBX1 才可以延长组核蛋白乳过酸装饰横向
研究分析会发现YBX1敲低差异性有效大大减少蛋白质酶质乳过酸,尤为是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解可以抑药品2-DG的实验设计查证了糖酵解与组蛋白质酶乳过酸的简单绑定,可以抑制性糖酵解可差异性有效大大减少H3K18la横向(图6D)。PKM2过体现可逆转转YBX1敲低形成的H3K18la减少,到外源乳酸解决并不是不断提升H3K18la,还周期性YBX1体现上浮,警告普遍存在正在向反映(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR查证,H3K18la用含有于YBX1开启子简单利于其转录,该流程受O-GlcNAc糖基化调节管控(图6H-J),并会发现P300 上浮是YBX1强化H3K18乳酰化为用的机能(图6K-L)。
图6.YBX1强化H3K18乳硝化作用呈现情况
文章内容工作小结
在某些学习中报道范文了YBX1在HCC中高表答,且与糖酵揭秘切想关。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,可以可靠球营养物质并增长其表答。本身装饰还可以淡化YBX1在T57处的磷碱化,可以淡化其核易位。以至于,某些环节减弱了糖酵解想关人类基因组的转录并条件刺激乳酸的形成。于此,YBX1成功激活P300的转录,而能动力组球血清的乳碱化,专门是H3K18la,H3K18乳碱化正向着自我调节YBX1人类基因组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传正反面馈环工作机制图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱海洋生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向治疗力量排泄组技术服务,拜谱海洋生物建立了完善成熟的转录组学、淀粉酶组学、译成后修饰语组学、新陈代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参看文献综述
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.