
2024年9月由扬州水产业一本大学张万刚硕士生导师的团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱动物为该研究提供了亚硝基化突显组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名字问题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2023年会影响细胞:5.7
公布事件:2024年9月
玩家公司的:南京农业大学
调查文件:蛋白
拜谱提供数据枝术:亚硝基化修饰组学
方法交通路线:
一、调查但是
01.Caspase-3灵活性
现在尚不明白NO对caspase-3的调控意义是否有归因于NO介导的S-亚硝基化,各种不同盐浓度梯度方向的GSNO作外源性NO厂家直销,以引导caspase-3的身体外S-亚硝基化。成果说明,与未GSNO的组优于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3可溶性可观影响(图1),与原本媒体报道保持一致。GSNO治疗影响caspase-3可溶性的未知原由仍仍待指出。
图1 与众不同有机废气浓度的GSNO除理对caspase-3吸附性的反应
02.Caspase-3的S-亚硝基化限度
的论述Caspase-3的亚硝基化层度上,以展现GSNO对Caspase-3的影响性。经GSNO工作后,探测到caspase-3核蛋白S-亚硝基化的强度增强(图2)。许多成果表面,外源性GSNO锻炼可完美诱惑caspase-3的身体外S-亚硝基化。更让人难以相信的是,在不能GSNO出现的对应组中探测到一绚烂的S-亚硝基化带,这表面caspase-3或许会发生内源性的S-亚硝基化。除外,本的论述中caspase-3的S-亚硝基化层度上较高,而caspase-3的特情人下降,这与以往的的论述相一致。那么,caspase-3的特情人S-亚硝基化突显位点尚不看不清楚,还需求进第一步的摸索。
图2 GSNO治理 对caspase-3S-亚硝基化技术水平的不良影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化表达组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。黄色标签的队列透露S-亚硝基化肽,粉红色标签的C透露S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3分解结核蛋白
结淀粉酶当做是一种重点的内部骨架淀粉酶,在保证肌内部设备构造的设备构造完成性和收缩毛孔性上起比较偏重点功能,探析S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶光挥发的铭理智拥有重点有何意义。与Std(未用胱天淀粉酶酶-3和GSNO孵育的起始肌钎维棉淀粉酶)组相对于,0 μM GSNO组(肌原钎维棉和caspase-3的孵育,无GSNO)的完成结淀粉酶分子量显著性降低了,温馨提示caspase-3对结淀粉酶拥有隐性的淀粉酶电离能力素质。在GSNO孵育后,完成结淀粉酶的分子量显然增强(P < 0.05)。不仅如此,当GSNO质量浓度增高时,完成结淀粉酶的分子量持继上涨(P < 0.05)(图5)。这类发觉是因为,SNO遮盖的caspase-3以含量忽略的办法压制结淀粉酶的光挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结淀粉酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3吸附肌钙球蛋白-T
肌钙淀粉酶-T (TnT)是原肌球淀粉酶缓解负责管理腿部肌肉缩紧的细细的的须得肌原化学仟维淀粉酶。TnT的溶解特殊性是论文探测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化因素下,caspase-3对TnT的溶解情况报告如图是6随时,与Std组(不包括caspase-3和GSNO的肌原化学仟维)较之,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写可观增添,表达caspase-3参与的了TnT的溶解,不但,caspase-3与GSNO的孵育会以至于30 kDa TnT下调。在100和200 μM GSNO组左右就没有论文探测到很明显的距离(P > 0.05),而当GSNO的溶度做到400 μM 时,该细节描写可观避免(P < 0.05)。这一些看到表达了SNO淡化的caspase-3对TnT溶解的减弱用途。结淀粉酶和TnT是caspase-3的灵敏底物,而GSNO加工处理下降caspase-3的化学活化或者会以至于肌原化学仟维淀粉酶溶解层次下降。总而言之表明,NO促进的S-亚硝基化可以经由淡化半胱氨酸残基来缓解caspase-3的化学活化,必将进两步导致其对结淀粉酶和TnT的淀粉酶淀粉水解功能,得以导致羊肉品控。
图6. S-亚硝基化caspase- 3吸附肌钙核蛋白-T
二、个人心得体会
本科研有赖于研究综述S-亚硝基化对caspase-3装饰的损害和其接着对牛羊肉肌原钎维身体可降解的损害。蛋清质S-亚硝基化可能装饰caspase-3的半胱氨酸残基,使得使得caspase-3灵活性削减,进步骤减弱了其对牛羊肉肌原钎维蛋清质的蛋清质蛋白质水解意识。三、拜谱总结
探讨用于了酶活测量,亚硝基化突显组学理论研究,WB等探测方式方法,知道球球淀粉酶质S-亚硝基化就能够突显caspase-3的半胱氨酸残基,这使得了caspase-3催化活性的消减,并举1步遏制了其对牛肉片肌原纤维棉球球淀粉酶质的球球淀粉酶质溶解特性。本探讨为解释一下球球淀粉酶质质亚硝基化对肉肥的管控工作机制作为了个新的上帝视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球营养素组学、绘制球营养素组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列表物料,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total钝化还原故宫场景、悬浮巯基,欢迎大家咨询!
选取文章:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663