
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探究然而
研究分析人员管理探究性学习随着时长推移要在冷冻冷藏室保存时长廷长牛羊肉的对抗强度标准、持水实力、凹凸感感、存在铁纯度、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4分量来测评胸肌团体受损受损细胞的铁消失工作状态。最终结果提示,要在冷冻冷藏室保存时长廷长后,牛羊肉的对抗强度标准在第5天和第6天同质性减退;持水实力消减;颜色等等变深,失却凹凸感,鲜朱粉红色化为暗朱粉红色。再者,存在铁、渗透性氧和MDA的纯度同质性添加,受损受损细胞凋亡率同质性偏高。 的研究员分离出差别冷冻精力的肌群组织备样的球营养素,然后呢展开SDS-PAGE定性定性分析,球营养素条带在差别期间匀称不匀且相拟(图1a)。利用球淀粉酶在差别备样中的理解情况报告,定性定性分析感觉某个组备样的中个数比较敏感于某个横向(图1b),表示肌群组织备样球营养素兼备稳定的组内相拟性和组间差别性。 核营养素组学共鉴别费出1996种核营养素。以B0为参考组,淘汰B1、B2、B4和B6中的核核苷酸做出对比体现研究,共鉴别费到37七个DEPs。将火山图交互,并按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两位标准研究DEP。导致如图甲提示1c-f提示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别鉴别费出22、33、73和140个DEPs,这其中分刘海别上浮6、11、32和83个,调整16、22、41和52。聚类分析法最简单的方法鉴定了不一样的食品冷藏第一阶段手臂背部肌肉组织机构中核营养素的体现,导致彰显手臂背部肌肉核核苷酸体现对比时段推移贮存时段的曾加而曾加(图1g)。
图1| 不一样的冷藏库时光的腹肌样件脂肪酸质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所不同保鲜冷库时刻的肌打样定制一定的差异球蛋白介绍(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死淀粉酶肽的PRM化学发光法研究分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依据KEGG聚集距离表达爱球蛋白的铁伤亡管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物技术提供了TMT定量分析球核蛋白质含量组学水平安全提供服务,拜谱生物学已研究开发到位并搭建了加强发育成熟的转录组学、球核蛋白组学、代谢率组学还有几组学联合技術软件水平安全提供服务系统,欢迎致电咨询!
决定性论文资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.